Son raros los problemas serios causados por esta vacuna. Por lo menos una de cada diez personas que reciben la vacuna tiene algunos efectos que pueden durar hasta un día, como dolor, hinchazón y enrojecimiento en el sitio donde se aplica la inyección, dolor de cabeza, dolor muscular y cansancio. Hay algunos efectos secundarios menos comunes como fiebre, malestar, mareos, diarrea y dolores musculares. Raramente las personas pueden desarrollar urticaria o reacciones alérgicas severas como con cualquier otro medicamento. No se ha encontrado que la presencia de enfermedades graves sea más frecuente en las poblaciones vacunadas que en las no vacunadas, es decir no se ha asociado con el desarrollo de ningún tipo de enfermedad.

De manera ocasional, esta y otras vacunas que se aplican en adolescentes, puede producir desmayo, por lo que se recomienda que la niña se vacune sentada y permanezca sentada durante por lo menos 15 minutos después de la vacunación.​